Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTF3P20783 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTF3P20783 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTF3P20783 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTF3P20783 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTF3P20783 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTF3P20783 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTF3P20783 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTF3P20783 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTF3P20783 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NTF3P20783 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NTF3P20783 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NTF3P20783 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTF3P20783 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTF3P20783 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTF3P20783 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NTF3P20783 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NTF3P20783 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NTF3P20783 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms