Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRHP20396 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRHP20396 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRHP20396 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRHP20396 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRHP20396 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRHP20396 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRHP20396 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRHP20396 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRHP20396 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRHP20396 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRHP20396 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
TRHP20396 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRHP20396 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRHP20396 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRHP20396 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRHP20396 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRHP20396 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRHP20396 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
TRHP20396 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
TRHP20396 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRHP20396 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRHP20396 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRHP20396 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRHP20396 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRHP20396 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRHP20396 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRHP20396 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRHP20396 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRHP20396 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRHP20396 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRHP20396 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRHP20396 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRHP20396 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRHP20396 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRHP20396 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRHP20396 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TRHP20396 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TRHP20396 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRHP20396 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRHP20396 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRHP20396 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
TRHP20396 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
TRHP20396 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRHP20396 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRHP20396 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRHP20396 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TRHP20396 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRHP20396 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRHP20396 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TRHP20396 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TRHP20396 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRHP20396 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRHP20396 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRHP20396 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRHP20396 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRHP20396 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRHP20396 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRHP20396 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TRHP20396 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRHP20396 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
TRHP20396 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRHP20396 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRHP20396 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
TRHP20396 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRHP20396 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRHP20396 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRHP20396 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRHP20396 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRHP20396 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRHP20396 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRHP20396 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRHP20396 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRHP20396 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
TRHP20396 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRHP20396 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRHP20396 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRHP20396 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRHP20396 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRHP20396 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRHP20396 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRHP20396 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRHP20396 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TRHP20396 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TRHP20396 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms