Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRM3P20309 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms