Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DPA1P20036 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DPA1P20036 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DPA1P20036 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms