Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2B1P20020 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP2B1P20020 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B1P20020 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms