Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFEBP19484 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFEBP19484 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFEBP19484 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFEBP19484 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFEBP19484 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFEBP19484 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFEBP19484 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFEBP19484 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFEBP19484 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFEBP19484 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFEBP19484 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFEBP19484 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFEBP19484 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFEBP19484 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFEBP19484 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFEBP19484 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFEBP19484 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFEBP19484 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFEBP19484 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFEBP19484 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFEBP19484 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFEBP19484 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TFEBP19484 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFEBP19484 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFEBP19484 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFEBP19484 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TFEBP19484 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFEBP19484 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFEBP19484 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFEBP19484 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFEBP19484 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFEBP19484 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFEBP19484 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFEBP19484 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFEBP19484 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFEBP19484 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFEBP19484 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFEBP19484 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFEBP19484 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFEBP19484 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFEBP19484 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFEBP19484 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFEBP19484 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms