Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN2P17655 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN2P17655 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms