Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF7P17544 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF7P17544 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF7P17544 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF7P17544 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF7P17544 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF7P17544 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF7P17544 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF7P17544 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF7P17544 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF7P17544 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF7P17544 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF7P17544 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF7P17544 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF7P17544 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF7P17544 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF7P17544 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF7P17544 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF7P17544 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF7P17544 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF7P17544 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF7P17544 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF7P17544 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF7P17544 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF7P17544 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF7P17544 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF7P17544 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF7P17544 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF7P17544 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF7P17544 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF7P17544 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF7P17544 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF7P17544 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF7P17544 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF7P17544 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF7P17544 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF7P17544 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF7P17544 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF7P17544 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF7P17544 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF7P17544 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF7P17544 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF7P17544 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF7P17544 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF7P17544 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF7P17544 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF7P17544 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF7P17544 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF7P17544 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms