Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMPD1P17405 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMPD1P17405 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms