Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms