Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LCP1P13796 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCP1P13796 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCP1P13796 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCP1P13796 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCP1P13796 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCP1P13796 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCP1P13796 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCP1P13796 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCP1P13796 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCP1P13796 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCP1P13796 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCP1P13796 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCP1P13796 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LCP1P13796 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCP1P13796 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCP1P13796 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCP1P13796 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCP1P13796 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCP1P13796 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCP1P13796 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LCP1P13796 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCP1P13796 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCP1P13796 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms