Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT5P13647 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT5P13647 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT5P13647 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT5P13647 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT5P13647 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT5P13647 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT5P13647 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT5P13647 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT5P13647 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT5P13647 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT5P13647 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT5P13647 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT5P13647 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT5P13647 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT5P13647 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT5P13647 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT5P13647 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT5P13647 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT5P13647 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT5P13647 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT5P13647 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT5P13647 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
KRT5P13647 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT5P13647 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT5P13647 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT5P13647 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT5P13647 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT5P13647 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT5P13647 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT5P13647 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT5P13647 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT5P13647 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT5P13647 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT5P13647 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT5P13647 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT5P13647 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT5P13647 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT5P13647 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT5P13647 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT5P13647 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT5P13647 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT5P13647 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT5P13647 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT5P13647 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT5P13647 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT5P13647 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT5P13647 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms