Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCKDHAP12694 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCKDHAP12694 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCKDHAP12694 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms