Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARSP12081 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARSP12081 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARSP12081 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARSP12081 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HARSP12081 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARSP12081 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARSP12081 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARSP12081 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARSP12081 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARSP12081 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARSP12081 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARSP12081 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HARSP12081 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARSP12081 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARSP12081 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARSP12081 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARSP12081 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARSP12081 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARSP12081 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARSP12081 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HARSP12081 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HARSP12081 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HARSP12081 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HARSP12081 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HARSP12081 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARSP12081 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARSP12081 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HARSP12081 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARSP12081 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARSP12081 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARSP12081 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARSP12081 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARSP12081 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARSP12081 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARSP12081 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARSP12081 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARSP12081 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARSP12081 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARSP12081 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARSP12081 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms