Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRFP11831 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRFP11831 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFP11831 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFP11831 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFP11831 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFP11831 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFP11831 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFP11831 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRFP11831 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRFP11831 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFP11831 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFP11831 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFP11831 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFP11831 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFP11831 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFP11831 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRFP11831 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFP11831 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFP11831 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFP11831 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFP11831 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFP11831 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRFP11831 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRFP11831 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRFP11831 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRFP11831 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRFP11831 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFP11831 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRFP11831 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRFP11831 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRFP11831 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRFP11831 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRFP11831 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRFP11831 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRFP11831 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRFP11831 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFP11831 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRFP11831 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms