Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNAT1P11488 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GNAT1P11488 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNAT1P11488 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms