Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2F1P10589 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR2F1P10589 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms