Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-3P0DP02 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms