Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC172P0C7W6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC172P0C7W6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC172P0C7W6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms