Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP1P09455 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP1P09455 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP1P09455 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP1P09455 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP1P09455 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP1P09455 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP1P09455 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP1P09455 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP1P09455 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP1P09455 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP1P09455 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP1P09455 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP1P09455 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP1P09455 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP1P09455 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP1P09455 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP1P09455 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP1P09455 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP1P09455 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP1P09455 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP1P09455 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP1P09455 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP1P09455 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP1P09455 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP1P09455 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP1P09455 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP1P09455 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP1P09455 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP1P09455 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP1P09455 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP1P09455 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP1P09455 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP1P09455 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP1P09455 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms