Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSBP07858 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSBP07858 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSBP07858 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSBP07858 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSBP07858 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSBP07858 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSBP07858 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSBP07858 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSBP07858 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSBP07858 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSBP07858 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSBP07858 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSBP07858 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSBP07858 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSBP07858 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSBP07858 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSBP07858 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSBP07858 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSBP07858 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSBP07858 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSBP07858 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSBP07858 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSBP07858 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSBP07858 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSBP07858 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSBP07858 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSBP07858 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSBP07858 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSBP07858 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSBP07858 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSBP07858 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSBP07858 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTSBP07858 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms