Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CSF1RP07333 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSF1RP07333 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSF1RP07333 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms