Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLBP06746 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLBP06746 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLBP06746 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLBP06746 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLBP06746 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLBP06746 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLBP06746 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLBP06746 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLBP06746 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLBP06746 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLBP06746 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLBP06746 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLBP06746 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLBP06746 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLBP06746 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLBP06746 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLBP06746 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLBP06746 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLBP06746 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLBP06746 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLBP06746 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLBP06746 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLBP06746 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLBP06746 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLBP06746 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLBP06746 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLBP06746 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLBP06746 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLBP06746 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLBP06746 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLBP06746 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLBP06746 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLBP06746 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLBP06746 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLBP06746 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLBP06746 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLBP06746 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLBP06746 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLBP06746 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms