Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALB1P05937 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALB1P05937 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALB1P05937 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALB1P05937 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CALB1P05937 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALB1P05937 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB1P05937 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB1P05937 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB1P05937 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB1P05937 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALB1P05937 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB1P05937 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB1P05937 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB1P05937 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALB1P05937 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALB1P05937 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALB1P05937 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALB1P05937 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALB1P05937 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALB1P05937 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALB1P05937 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALB1P05937 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALB1P05937 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALB1P05937 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB1P05937 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB1P05937 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB1P05937 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB1P05937 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB1P05937 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB1P05937 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALB1P05937 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB1P05937 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB1P05937 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB1P05937 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB1P05937 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALB1P05937 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALB1P05937 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALB1P05937 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms