Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3DP05423 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3DP05423 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3DP05423 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3DP05423 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3DP05423 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLR3DP05423 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3DP05423 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3DP05423 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR3DP05423 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR3DP05423 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLR3DP05423 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3DP05423 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3DP05423 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3DP05423 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3DP05423 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3DP05423 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3DP05423 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR3DP05423 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3DP05423 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3DP05423 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3DP05423 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3DP05423 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3DP05423 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3DP05423 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3DP05423 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLR3DP05423 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms