Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHBGP04278 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHBGP04278 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHBGP04278 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHBGP04278 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHBGP04278 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHBGP04278 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHBGP04278 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHBGP04278 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHBGP04278 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHBGP04278 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHBGP04278 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHBGP04278 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHBGP04278 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHBGP04278 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHBGP04278 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SHBGP04278 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHBGP04278 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHBGP04278 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHBGP04278 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHBGP04278 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHBGP04278 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHBGP04278 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHBGP04278 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHBGP04278 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHBGP04278 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHBGP04278 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHBGP04278 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHBGP04278 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHBGP04278 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHBGP04278 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHBGP04278 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHBGP04278 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHBGP04278 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHBGP04278 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHBGP04278 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHBGP04278 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHBGP04278 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHBGP04278 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHBGP04278 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHBGP04278 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHBGP04278 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHBGP04278 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms