Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOEP02649 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOEP02649 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOEP02649 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOEP02649 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOEP02649 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOEP02649 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOEP02649 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOEP02649 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOEP02649 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOEP02649 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOEP02649 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOEP02649 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOEP02649 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOEP02649 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOEP02649 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOEP02649 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOEP02649 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOEP02649 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOEP02649 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOEP02649 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOEP02649 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOEP02649 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOEP02649 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOEP02649 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOEP02649 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOEP02649 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOEP02649 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOEP02649 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOEP02649 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOEP02649 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOEP02649 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOEP02649 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOEP02649 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOEP02649 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOEP02649 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOEP02649 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOEP02649 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOEP02649 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOEP02649 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOEP02649 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOEP02649 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOEP02649 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOEP02649 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms