Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTA1P02549 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTA1P02549 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTA1P02549 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms