Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERPINA1P01009 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms