Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINC1P01008 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SERPINC1P01008 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms