Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX11BO96011 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX11BO96011 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms