Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX7O95931 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX7O95931 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX7O95931 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX7O95931 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX7O95931 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX7O95931 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX7O95931 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX7O95931 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX7O95931 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX7O95931 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX7O95931 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX7O95931 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX7O95931 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX7O95931 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX7O95931 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX7O95931 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX7O95931 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX7O95931 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX7O95931 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX7O95931 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX7O95931 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX7O95931 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms