Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TSPAN13O95857 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TSPAN13O95857 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TSPAN13O95857 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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