Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC24AO95486 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24AO95486 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24AO95486 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms