Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF6BO95407 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFRSF6BO95407 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms