Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATE1O95260 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATE1O95260 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATE1O95260 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATE1O95260 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATE1O95260 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATE1O95260 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATE1O95260 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATE1O95260 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATE1O95260 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATE1O95260 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATE1O95260 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATE1O95260 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATE1O95260 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATE1O95260 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATE1O95260 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATE1O95260 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATE1O95260 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATE1O95260 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATE1O95260 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATE1O95260 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATE1O95260 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATE1O95260 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATE1O95260 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATE1O95260 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATE1O95260 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms