Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK1O94907 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK1O94907 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK1O94907 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK1O94907 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK1O94907 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK1O94907 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK1O94907 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DKK1O94907 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK1O94907 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK1O94907 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK1O94907 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK1O94907 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK1O94907 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK1O94907 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK1O94907 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK1O94907 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK1O94907 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK1O94907 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK1O94907 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK1O94907 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK1O94907 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DKK1O94907 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DKK1O94907 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK1O94907 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK1O94907 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK1O94907 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK1O94907 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK1O94907 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DKK1O94907 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DKK1O94907 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DKK1O94907 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms