Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF6O94906 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PRPF6O94906 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF6O94906 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms