Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UFL1O94874 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UFL1O94874 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UFL1O94874 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UFL1O94874 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UFL1O94874 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UFL1O94874 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
UFL1O94874 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UFL1O94874 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UFL1O94874 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UFL1O94874 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UFL1O94874 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UFL1O94874 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UFL1O94874 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UFL1O94874 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UFL1O94874 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UFL1O94874 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UFL1O94874 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UFL1O94874 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UFL1O94874 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UFL1O94874 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UFL1O94874 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UFL1O94874 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UFL1O94874 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UFL1O94874 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UFL1O94874 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
UFL1O94874 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
UFL1O94874 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UFL1O94874 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UFL1O94874 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UFL1O94874 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UFL1O94874 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UFL1O94874 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UFL1O94874 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UFL1O94874 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UFL1O94874 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UFL1O94874 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UFL1O94874 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UFL1O94874 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UFL1O94874 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UFL1O94874 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UFL1O94874 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UFL1O94874 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UFL1O94874 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms