Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP1O94782 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP1O94782 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP1O94782 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP1O94782 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP1O94782 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP1O94782 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP1O94782 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP1O94782 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP1O94782 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP1O94782 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP1O94782 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP1O94782 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP1O94782 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP1O94782 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP1O94782 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP1O94782 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP1O94782 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP1O94782 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP1O94782 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP1O94782 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP1O94782 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP1O94782 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP1O94782 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP1O94782 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP1O94782 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP1O94782 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP1O94782 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP1O94782 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP1O94782 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP1O94782 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP1O94782 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP1O94782 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP1O94782 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP1O94782 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP1O94782 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms