Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DCTN3O75935 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DCTN3O75935 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN3O75935 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms