Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABBR2O75899 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABBR2O75899 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABBR2O75899 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABBR2O75899 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR2O75899 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GABBR2O75899 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms