Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMPCBO75439 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMPCBO75439 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms