Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC45O75419 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC45O75419 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC45O75419 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC45O75419 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC45O75419 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC45O75419 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC45O75419 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC45O75419 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC45O75419 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC45O75419 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC45O75419 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC45O75419 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC45O75419 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC45O75419 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC45O75419 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC45O75419 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC45O75419 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC45O75419 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC45O75419 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC45O75419 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC45O75419 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC45O75419 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDC45O75419 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC45O75419 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC45O75419 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC45O75419 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC45O75419 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC45O75419 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC45O75419 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC45O75419 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1683.5 ms