Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX3O75364 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITX3O75364 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX3O75364 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX3O75364 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX3O75364 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX3O75364 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX3O75364 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX3O75364 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX3O75364 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX3O75364 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX3O75364 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX3O75364 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX3O75364 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PITX3O75364 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX3O75364 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX3O75364 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX3O75364 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms