Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP4O75096 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP4O75096 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP4O75096 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP4O75096 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP4O75096 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP4O75096 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP4O75096 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP4O75096 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP4O75096 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP4O75096 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP4O75096 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP4O75096 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRP4O75096 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRP4O75096 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP4O75096 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP4O75096 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP4O75096 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP4O75096 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP4O75096 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP4O75096 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP4O75096 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP4O75096 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP4O75096 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP4O75096 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP4O75096 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP4O75096 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP4O75096 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP4O75096 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP4O75096 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP4O75096 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP4O75096 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP4O75096 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP4O75096 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP4O75096 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP4O75096 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP4O75096 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP4O75096 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP4O75096 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP4O75096 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP4O75096 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP4O75096 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP4O75096 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP4O75096 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms