Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF4O60810 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms