Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
KIAA0556O60303 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
KIAA0556O60303 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIAA0556O60303 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KIAA0556O60303 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms