Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX6O43752 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX6O43752 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX6O43752 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX6O43752 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX6O43752 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX6O43752 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX6O43752 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX6O43752 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX6O43752 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX6O43752 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX6O43752 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX6O43752 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX6O43752 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX6O43752 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX6O43752 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STX6O43752 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX6O43752 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX6O43752 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX6O43752 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
STX6O43752 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STX6O43752 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
STX6O43752 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX6O43752 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX6O43752 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX6O43752 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX6O43752 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX6O43752 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX6O43752 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX6O43752 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX6O43752 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX6O43752 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX6O43752 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STX6O43752 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms