Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1O43719 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HTATSF1O43719 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HTATSF1O43719 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms